1、經常保持新生兒的口腔衛生，多飲水、禁用刺激性藥物，預防口腔炎症。
2、嚴格執行消毒隔離制度。
3、潰瘍疼痛嚴重者，可局部塗2%利多卡因止痛，保證患兒充分哺乳，以滿足其熱量和水分。局部可塗疱疹淨抑制病毒，亦可噴撒西瓜霜，錫類散等。
4、應注意做好口腔護理，保持口腔清潔，以修復創面，緩解疼痛。可先用0.9%NS或2%SB徹底清潔口腔，特別是潰瘍部位後局部塗上聚肌胞；為緩解患兒進食時疼痛，可於進食前10-15分鐘用2%利多卡因塗口腔。
5、為預防繼發感染可塗2.5％-5％金霉素魚肝油。疼痛嚴重者可在餐前用2％利多卡因塗抹局部。食物以微溫或涼的流質為宜，發熱時可用退熱劑，有繼發感染時可用抗生素。
6、治療疱疹性口腔炎，主要是控制感染，可用三氮唑核苷或口服板藍根沖劑，保持口腔清潔，以修復創面，緩解疼痛，此外應適當補充B族維生素。
