口腔潰瘍也有良性惡性之分，以下五點可以幫助患者進行鑒別：
一、按愈合時間區分。良性口腔潰瘍一般數天至數周可以愈合，而惡性口腔潰瘍則呈進行性發展，數月甚至一年多也不愈合。
二、按形態區分。良性口腔潰瘍一般形態比較規則，通常呈圓、橢圓或線條形，邊緣整齊清晰，與周圍組織分界清，凹陷的基底部較平滑，摸上去柔軟，有很明顯的疼痛感。而惡性口腔潰瘍形態不規則，邊界不清楚，有邊緣隆起、凹凸不平的特征，潰瘍的底部呈顆粒狀，摸上去較硬，疼痛不甚明顯。
三、：按病程區分。良性口腔潰瘍常反復發生，而惡性口腔潰瘍一旦發病就不愈合。
四、觀察全身情況。良性口腔潰瘍全身症狀比較少見，頸部淋巴結不腫大，或雖腫大但不硬、無粘連。惡性口腔潰瘍則與之相反，甚至有惡病質等全身症狀。
五、根據對藥物的敏感度判斷。良性口腔潰瘍一般在使用消炎防腐類藥物後愈合加快，效果明顯；而惡性口腔潰瘍則常常對藥物“不理不睬”，療效不明顯。必要時應進行病理檢查，以明確診斷，再做相應的治療。
