引起唇裂的確切原因和發病機理，目前尚未完全明了。根據大量的實驗研究及流行病學調查結果表明，可能為多種因素的影響而非單一的因素所致。概括說來，可分為遺傳因素及環境因素兩個方面，並與營養、遺傳、感染、內分泌等因素有關。
荷蘭科學家近日完成的一項研究顯示，婦女在妊娠期間進食富含肉類和水果較少的飲食，嬰兒發生唇裂或腭裂的風險增加1倍。該病例對照研究共納入了203例唇腭裂嬰兒的母親及178例正常嬰兒的母親。
研究者在嬰兒出生後14個月評價母親的營養攝入，測定其血清和紅細胞葉酸、血清維生素B12、全血維生素B6以及血漿同型半胱氨酸等生物標志物，並使用飲食類型，進行單因素和多因素分析及計算比值比。結果顯示，西方型飲食中肉類、比薩餅、豆類以及土豆較多而水果少，與唇腭裂風險升高相關（比值比1.9）。
健康型飲食中魚類、大蒜、堅果、蔬菜較多，增加維生素B12（P《0.001）和血清葉酸（P=0.05）水平，與唇腭裂風險無關。研究提示，西方型飲食可能使子代發生唇腭裂的風險升高1倍，妊娠前篩查項目中應當包括飲食和生活方式等內容。
預防寶寶唇裂，孕婦在懷孕期間應避免偏食，不要為了加強營養吃太多肉類，保證維生素B、C、D及鈣、鐵、磷的充分攝入，保持心境平和，避免精神緊張，不服用抗腫瘤藥物、抗驚厥藥、組胺藥、治療孕吐的克敏靜和某些安眠藥，不吸煙不酗酒，避免接觸放射線、微波等。
