潔牙會帶來危害嗎？答案是否定的。
正規的操作是不會傷害牙齒的。但如果在潔牙操作時給牙齒施壓過大，采用功率過大，或在同一個點上停留時間過長，甚至還用超聲機頭去刮的話，還是會損害牙齒表面的牙釉質。這些情況通常是由於牙結石太過頑固，用普通功率無法清除，且操作者對超聲潔牙只有粗淺的認識，一味追求“潔得干淨”，不考慮對牙齒的傷害。 某些小診所或美容院的非專業人員，為了追求效率和經濟效益，很容易采取這種粗魯的做法。去專業的口腔醫院潔牙，常常需要1到2個小時，而在許多小診所和美容院，二三十分鐘就能潔完，其效果可想而知。
此外，很多人都會潔牙後的一兩天感覺牙齒酸痛，對冷熱酸甜都會敏感，這主要是因為牙頸和牙根部本來就比較敏感，潔牙後失去了牙結石的隔絕“保護”，突然完全暴露於外界。遇到這種情況不用慌張，輕者只要幾天內避免冷熱的刺激，就能慢慢適應，重者可以去醫院接受防敏劑塗布治療。
一般人潔牙時都會有局部牙龈的出血，這和平時的牙龈出血一樣，也是炎症的表現，當結石碎裂脫離牙面時，碰到有炎症的牙龈就會引起出血，所以潔牙時出血多少也是反應炎症嚴重程度的一個指標。另外，在洗牙時混有潔牙機頭噴出的水及本人的唾液，也會造成出血多的假象。潔牙之後還需要用抗菌液含漱、沖洗上藥，以減輕牙龈的炎症。
正規的潔牙操作不但不會造成牙齒松動，相反是預防和治療牙周炎症的有效手段，可以防止牙齒的進一步松動
