慢性根尖周炎一般沒有明顯的自覺症狀，常常因為咀嚼不適或牙龈起膿包而就診。慢性根尖周炎多由牙髓炎或急性根尖周炎發展而來，患牙常常有牙髓病史、反復腫脹史或牙髓治療史。
醫生查體時常常發現患牙存在深的齲洞或充填體，或其他的牙體硬組織疾患。牙冠變色，失去光澤，深洞內探診無反應，牙髓活力測驗無反應。當根尖部的炎症通過骨質擴散到牙龈時，可在患牙的牙龈處看見瘘道的開口。叩診患牙可出現不適感或無反應。如果拍X線片，可發現根尖部有密度減低區，這是由於根尖牙槽骨被破壞所致。
