錯颌畸形形成因素及其機理是錯綜復雜的。其發生的過程可能由單一因素或單一機理在起作用，但也可能是多種因素或多種機理共同作用的結果，這些因素影響到颌面部的骨骼、神經、肌肉、牙齒和軟組織的生長發育，使其發生異常改變繼而形成錯牙畸形.
錯牙畸形的發病因素一般為遺傳性因素和獲得性因素兩大類。遺傳因素主要為種族演化和退化，遺傳因素大約占30%。獲得性因素有以下幾方面：
(1)乳牙早失：會出現間隙不足，產生擁擠錯位。失去導萌作用，恆牙萌出時出現錯位和無法萌出.
(2)不良習慣：多數為吮指習慣、舌習慣、咬唇習慣、咬物習慣、伸下颌習慣、不良吞咽習慣、偏側咀嚼習慣等，可以引起各種各樣的錯牙合.
(3)多生牙：多生牙能引起牙、颌系統的形態動能紊亂，中切牙間多生牙可導致中切牙間隙的形成等。
(4)先天性缺失牙：多為發育和胚胎原因，第三磨牙的缺失多為種系發生的退化現象.
(5)乳牙滯留：個別牙逾期不脫落為乳牙滯留，可導致繼替恆牙萌出被阻而呈埋伏，或錯位萌出.
(6)乳尖牙磨耗不足：因為兒童吃的食物過軟，所以有的乳尖牙不如其他牙齒磨耗多，因而高出牙弓牙面，產生早接觸，造成前方或側方移動，形成反牙.
(7)另外還有許多全身因素和局部疾病因素，如傳染病、營養不良、內分泌因素、維生素缺乏、唇腭裂、下颌髁狀突良性肥大症、顏面肥大症等。
